Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff2Q03404 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms