Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms