Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VcpQ01853 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms