Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Top2aQ01320 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms