Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P58686 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P58686 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P58686 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P58686 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P58686 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P58686 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P58686 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P58686 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P58686 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P58686 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P58686 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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