Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irf5P56477 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf5P56477 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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