Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TspoP50637 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TspoP50637 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms