Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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