Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms