Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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