Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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P20040 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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P20040 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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P20040 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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P20040 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P20040 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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P20040 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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P20040 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P20040 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P20040 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P20040 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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P20040 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P20040 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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P20040 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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P20040 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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P20040 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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P20040 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P20040 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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