Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NefhP19246 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NefhP19246 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms