Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim30aP15533 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms