Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RhoP15409 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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