Protein–RNA interactions for Protein: P01802

Ig heavy chain V-III region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01802 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01802 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01802 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01802 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01802 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01802 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01802 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01802 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01802 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01802 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01802 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms