Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P01747 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P01747 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms