Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SlkO54988 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SlkO54988 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms