Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms