Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3278L7N2D2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms