Protein–RNA interactions for Protein: J3KMK6

Gm21775, Predicted gene, 21775, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21775J3KMK6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21775J3KMK6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms