Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn20G5E8X0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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