Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms