Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Rnf148G3X9R7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf148G3X9R7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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