Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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H2-M1F7CXU4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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H2-M1F7CXU4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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H2-M1F7CXU4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
H2-M1F7CXU4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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