Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf212F6TQD1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms