Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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R3hdm1E9Q9Q2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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R3hdm1E9Q9Q2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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