Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms