Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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