Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf217D3YYI7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms