Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms