Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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