Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a6B1AVK5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms