Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms