Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms