Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt27Q9Z320 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krt27Q9Z320 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms