Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms