Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms