Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pdpk1Q9Z2A0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pdpk1Q9Z2A0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pdpk1Q9Z2A0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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