Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk3Q9QZL0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms