Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rdh11Q9QYF1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rdh11Q9QYF1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rdh11Q9QYF1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rdh11Q9QYF1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rdh11Q9QYF1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rdh11Q9QYF1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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