Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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