Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms