Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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CubnQ9JLB4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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CubnQ9JLB4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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CubnQ9JLB4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CubnQ9JLB4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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