Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms