Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Aff4Q9ESC8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Aff4Q9ESC8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Aff4Q9ESC8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Aff4Q9ESC8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Aff4Q9ESC8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Aff4Q9ESC8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Aff4Q9ESC8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Aff4Q9ESC8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Aff4Q9ESC8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Aff4Q9ESC8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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