Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnft1Q9DCN7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnft1Q9DCN7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnft1Q9DCN7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnft1Q9DCN7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnft1Q9DCN7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnft1Q9DCN7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnft1Q9DCN7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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