Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Jam3Q9D8B7 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Jam3Q9D8B7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Jam3Q9D8B7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Jam3Q9D8B7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Jam3Q9D8B7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Jam3Q9D8B7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Jam3Q9D8B7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Jam3Q9D8B7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Jam3Q9D8B7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Jam3Q9D8B7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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