Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UvssaQ9D479 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UvssaQ9D479 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms