Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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