Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Urm1Q9D2P4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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